魔法禁书目录第三季是由锦织博  樱美胜志  铃木健太郎  桥本敏一  筱原正宽  小林孝志  森义博  小野田雄亮  泉明宏  佐藤和磨  三好正人  野上良之  粟井重纪  执导，阿部敦  井口裕香  冈本信彦  日野聪  佐藤利奈  胜杏里  岸尾大辅  樱井浩美  洲崎绫  佐佐木望  日高里菜  加隈亚衣  谷山纪章  伊藤静  新井里美  丰崎爱生  能登麻美子  川原庆久  福圆美里  藤村步  古山贵实子  原由实  甲斐田裕子  冬马由美  仲野裕  土井美加  小清水亚美  松风雅也  赤崎千夏  内田真礼  井泽诗织  木内太郎  等人主演的，于2018年上映，该日本动漫讲述的是：　　位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约8成是学生的这座都市中，实施着超能力开发的特殊课程，学生们的能力被给予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。
　　高中生上条当麻，也是住在学园都市的学生之一。他由于隐藏在右手中的力量——只要是异能之力，就连神的加护都能消除的“幻想杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的“无能力”，过着充满不幸的人生。
　　而上条的学生生活，由于暑假开始时从天而降的纯白修女而发生了巨大的变化。自从与逃离“魔法”世界的她——“禁书目录茵蒂克丝”相遇开始，上条就被卷入了各种各样的事件中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝关联的“魔法”方，在惊险地解决双方事件的过程中，他的人际关系也逐步扩展。之后，魔法一方的十字教最大宗派罗马正教，终于注意到上条的存在……。
　　如同呼应魔法方一般，科学方的学园都市也有所动作。但也有与逐渐开始对立的世界动向抗争的人不断出现。那些通过与上条有所关联，而使命运大为改变的“英雄”们。
　　他们挺身而出与世界对峙。如同上条当麻做过的那样。
　　科学与魔法第三次交织之时，故事将大幅推进！！